Eu consigo comentar e abonar comunidades federadas de outras instâncias, ou eu preciso fazer um usuário no lemmy.ml para poder interagir com as comunidades lá?

O fato de ser federado é só para facilitar ler posts e achar comunidades de outras instâncias?

Pode usar o seu do lemmy.eco.br, inclusive estou respondendo você com o meu usuário do lemmy.pt, dá para fazer tudo o que você faz na sua instância em outras. A federação permite que use as outras instâncias como se estivesse na sua.